再到后来，楼兰古国已不存于世，只在零星的史料中出现，如法显西行途径楼兰，那里已经是“上无飞鸟，下无走兽，遍望极目，欲求度处则莫知所疑，惟以死人枯骨为标志耳 。”再到后来，到了南朝宋文帝元嘉二十二年，楼兰改名后的鄯善国也被丁零人所灭 ， 此后1500年的中国历史中，再也找不到楼兰的一丝痕迹 。
楼兰因何而消亡？楼兰在南北朝时已经完全销声匿迹，原来曾经水草丰茂的绿洲之地也被流沙湮没，只留下枯死的胡杨林和废弃的遗迹向世人证明着当年的辉煌 。
这与汉朝大量屯田有关！
班超出使西域后，其子班勇子承父业，也为大汉守卫着西域边疆 。西域虽然金银不少，但对边军来说，更缺乏的却是粮草 。于是作为西域长史的班勇派手下大将索励率驻酒泉、敦煌之汉兵来到楼兰屯田，以供汉军军需 。
为了屯田，他们在孔雀河下游拦河筑堤，引水开荒 ， 目的就是将楼兰之地打造成汉军在西域的粮食基地 。此地确实土地肥沃，适合耕种，仅仅四年便“积粟百万”，西域汉军再也不用受无粮之苦 。班勇和索励也因此受到朝廷的褒奖 。
但这种屯田却是以牺牲生态环境作为代价的！由于数千名汉军的驻守，夺林为田，大肆砍伐树木建房，又因贵族大肆兴建“太阳墓” ， 加上孔雀河被拦使得下游楼兰古城水源逐渐断绝 ， 楼兰古城再也不适合人类居?。荒芊掀?。
楼兰人离开故城，只能围绕汉军驻扎之地建房造城，这又使得大量树木被砍伐，之前楼兰古城的悲剧再次在罗布泊西岸的新城降临，孔雀河的水流越来越?。鸾ゲ还簧钤谡馄痰刂腥怂?。
这个时候有人意识到树木的生态问题 ， 河水资源和绿洲资源成为困扰他们的新问题，于是鄯善国国王下令“砍伐一颗活树者罚马一匹 ， 砍到树苗者罚羊两只 。”但是这样的律令只针对楼兰普通百姓，而对楼兰国的贵族以及神职人员，还有汉军是丝毫没有约束力的，于是整个楼兰地区被沙漠吞并的脚步并未停下 。
随后，塔里木河改道，孔雀河主流也跟着改了道，向南汇入了塔里木河，整个楼兰地区树木农作物枯死，河道干涸 ， 绿地再也经受不住风沙的侵袭而变成荒漠，楼兰人被迫迁移，楼兰就这样走进了历史的风沙中，再无影踪 。
时至如今，罗布泊周围地区还流传着一句俗语：沙漠是干涸了的海，楼兰是沉没了的船 。这句话依稀可以看出当年楼兰的风貌 。
楼兰人是什么人种 ， 时至今日他们的后裔何在？我们从1981年发现的“楼兰女尸”中不难看出，该女性是一个高鼻、小脸、金发、长睫毛的女性，这是一个生活在距今3800年的女性，与如今的塔吉克斯坦的女性相像 。
后来经过科学论证，在楼兰孔雀河附近发掘出的女尸，从人种学角度看与“帕米尔赛克”人种（地中海类型）、“安德罗诺沃”人种（欧罗巴人种）以及敦煌附近的月氏人接近；但从文字来看，楼兰人用的是中亚人通用的佉卢文为主；从语言来看，他们又用的是印欧语系的吐火罗语 。
看到这里，我们不仅产生可一个巨大的疑问，难道欧罗巴人真正乘坐“诺亚方舟”来到楼兰这个地方？
但是一千五百多年过去了，要找到真正的答案已经是不可能的事 ， 除非将来再有新的史料出土佐证，那现在我们只能依靠推断来判断楼兰人到底是什么人种，什么民族构成 。
依照出土的楼兰女尸衣着打扮来看，与现在位于中亚的塔吉克斯坦的民族打扮类似；结合其所用之佉卢文来看，它又是巴基斯坦、印度白人以及阿富汗等地早期使用的文字；而楼兰人日常所说之吐火罗语也是中亚早期普遍使用的语言，它是一种印欧语系中的一种，印度白人也是使用此语言最广泛的民族之一；再结合楼兰人的长相看，高鼻梁、深眼窝、黄头发是典型的白人特征 。种种迹象表明，楼兰人与印度白人应该是同一种族才是 。

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